1. 脓毒血症所致感染性休克、多器官功能衰竭的综合治疗：脓毒血症是机体对感染的炎症反应失调从而引起生理、生物和生化异常的临床综合征。脓毒血症和后续炎症反应可导致多器官功能障碍综合征（MODS）和死亡。从脓毒症到脓毒性休克，疾病的严重程度连续增加。对脓毒血症及其所致感染性休克及MODS的治疗水平也体现了学科对危重症病例的处治能力。我科从1990年开始在MODS中率先尝试人工血液滤过治疗，随后针对危重症患者的肾功能不全使用床旁血液透析（HF），针对MODS和Spesis开展连续静脉血液滤过（CRRT）和血液透析滤过（HDF），已形成完整的操作规程。从2003年开始更新设备，并应用CRRT技术治疗重症感染，将CRRT应用于治疗急性呼吸窘迫综合症、全身炎症反应综合症等重症感染性疾病患者，组织协调与本院呼吸科、ICU、肾内科组成MDT团队，明显提高了患者的生存率，已成为脓毒血症的区域诊治中心。
2. 不明原因重症肺炎及呼吸衰竭治疗：重症肺炎是一种严重甚至致死性的重症感染性疾病，感染起源于肺部，可快速进展进而出现呼吸衰竭。该病多为快速进展性疾病，临床上重症肺炎及并发的全身炎症反应综合征、多脏器功能衰竭等严重威胁患者生命，病死率为30％～50％。重症肺炎的形成是致病微生物与机体相互作用的结果，机体对致病微生物反应的“过”和“不及”均是形成重症肺炎的基础。临床重症肺炎的病原学常不明，这也给诊治带来困难。我科在处理不明原因肺炎诊断方面一直处于国内领先，现临床治疗方面除重视对致病微生物的控制杀灭，另一方面也关注调节患者的免疫状态，一改以往临床治疗中仅单纯强调抗感染药等控制感染，不注意免疫支持治疗的误区。为重症肺炎患者有良好预后提供了重要保障。
3. FUO的诊断和治疗：FUO在国际国内均有其准确的定义，它包含了三点：第一，发热时间持续3周以上；第二，体温数次超过38.3℃；第三，经至少1周完整的病史询问、体检和常规实验室检查不能确诊。因此，虽然FUO本身是症状诊断，不是疾病的诊断，但是要求仍然十分严格。对FUO的诊治能力很大程度体现了科室的整体诊治水平。而我科对FUO诊治已达到国际先进水平。科室从七十年代末在中国开始研究FUO，建立了中国FUO诊断的诊断标准和临床路径。对FUO的诊断准确率在国内领先，诊断确诊时间平均只需11.4天，达到国际领先水平。其影响范围除重庆及周边区县，甚至辐射至云、贵、川及其他省市，无数FUO患者慕名而来，我科均以快速且高效的诊治回应患者及家属的信任，也取得就诊者一致好评。
4. 以结核性、新隐球菌、化脓性脑膜炎为代表的中枢神经系统感染治疗：中枢神经系统感染是指各种生物性病原体引起的中枢神经系统炎症，是神经系统常见的疾病之一。具有发病急、进展快、病情危重的特点，是一类严重威胁人类健康的疾病。而在引起中枢神经系统感染的病原微生物中，以细菌、结核及隐球菌居多，也可见病毒、寄生虫等。我科长期收治各种病原体所致中枢神经系统感染，其中隐球菌收治病例数位居全国第三，积累了大量的临床诊治经验。并且，我科擅长治疗难治性中枢神经系统感染，如重症结核性脑膜炎合并新型隐球菌性脑膜炎等，并擅长处理相关并发症，为提升患者生活质量提供保障。
5. 难治性多重耐药菌社区/医院获得性感染治疗：多重耐药菌（MDRO），主要是指对临床使用的三类或三类以上抗菌药物同时呈现耐药的细菌。我科从80年代开始在国内率先开展细菌耐药监测和细菌耐药机制研究，是中国细菌耐药监测中心、国家细菌耐药监测组、全国院内感染致病菌监测西区代表。针对长期不正规的抗生素使用导致MRSA、VRSA、VRE、ESBL等严重多重耐药细菌迅速增多，本亚专业联合医院感染科、临床微生物和临床药理部、对我院多重耐药菌开展目标监测控制。建立多重耐药菌感染快速诊断方法，并对泛耐药菌进行体内外联合治疗药物筛选，并接受全院32个临床科室有关细菌感染、细菌耐药及抗生素使用方面的会诊（会诊量高达1万人次以上/年），及时对医院各科室出现的耐药菌指导其采取隔离措施、采取有效地治疗手段，降低了感染病人死亡率及院内感染发生率、多重耐药菌发生率，有效控制了院内感染发生。由于本专业在国内首创，将细菌感染的临床-微生物检验-临床药理三者整合在一起，极大地提高了多重耐药菌感染的诊断准确率和治疗成功率。这种先进的抗感染治疗模式在国内处于领先水平。
6. 各种深部真菌感染诊断和治疗：深部真菌感染指真菌侵犯皮下组织、黏膜和内脏所引起的感染性疾病，包括限局性的单一器官感染和2个或2个以上器官（组织）侵犯的系统性真菌感染。前者如肺念珠菌病、上颌窦曲霉病等，后者如播散性念珠菌病、真菌血流感染等。因深部真菌诊断困难，部分病原菌株对抗真菌药物不敏感，故所引起的感染危害极大。我科长期致力于深部真菌的诊断及治疗，率先提出最佳处理包括早期诊断和早期启动抗真菌治疗，并重视个体化治疗策略的应用。因多数深部真菌感染患者常有机体免疫功能差等情况，故提出尽早开展免疫功能监测，有效地了解机体状况，并以此为基础制订抗感染疗程。
7. 感染性心内膜炎：感染性心内膜炎（IE）是指由细菌、真菌和其他微生物（如病毒、立克次体、衣原体、螺旋体等）直接感染而产生心瓣膜或心室壁内膜的炎症，有别于由于风湿热、类风湿、系统性红斑狼疮等所致的非感染性心内膜炎。在FUO的病种中，感染性心内膜炎常常善于伪装，临床诊断困难。我科提出反复、多次、双瓶双套抽取血培养进行病原学查因，积极与超声科协作，对瓣膜赘生物进行精准探查，并协同心血管内科、胸心外科等行MDT讨论，诊治了无数不典型感染性心内膜炎病例，在西南地区取得较好口碑。
8. 感染性腹泻：感染性腹泻指各种病原体肠道感染而引起的腹泻。根据腹泻的持续时间长短，可将其分为急性（<14天），持续性（14～29天）或慢性（≥30天）。病原体主要包括细菌、病毒、寄生虫和真菌等。诊断依赖于病原学证据，我科现有重庆市传染病与寄生虫病重点实验室，善于各类标本的病原学培养及鉴定，为诊断感染性腹泻致病病原体提供了强大的实验室保障，尤其在对于培养周期长、培养难度大的病原微生物的鉴定方面具有丰富经验。
9. 气性坏疽等复杂皮肤软组织感染：复杂皮肤软组织感染（SSTI）包括深部软组织感染，如坏死性感染，感染性溃疡，感染性烧伤及严重脓肿，一些需要较大外科手术干预进行引流和清创。其中，病原体涉及多重耐药菌的皮肤软组织感染诊治难度大。近15年中，我国经历数次突发公共卫生事件，诸如2008年5.12汶川大地震，我科在救治伤员气性坏疽等皮肤软组织感染等病例上做到零感染、零截肢的奇迹。
10. 破伤风：破伤风是一种神经系统疾病，其特征为肌肉痉挛，由在土壤中发现的破伤风梭状芽胞杆菌。疾病特征为骨骼肌强直性收缩和间歇性剧烈的肌肉痉挛。常引起呼吸衰竭、医院感染和血栓栓塞等，故治疗难度大。我科长期与耳鼻喉科、重症医学科合作，建立重症破伤风诊治联盟，做到快速诊断，快速解除呼吸道阻塞，快速对症支持治疗，提升破伤风治愈率。
11. 合并多种并发症的肝硬化、肝衰竭：合并多种并发性的肝硬化、肝衰竭死亡率极高。我科现自主开展病毒性肝炎基因分型、耐药基因检查、高精DNA和RNA定量检测，以提升诊断水平。治疗上联合血管外科使用TIPS治疗肝硬化门脉高压，已开展3年，完成45例；为了提高肝衰竭病人肝移植成功率，感染科与肝胆外科合作，全面参与移植病人全程内科管理。从移植受体的筛选、术前病人维持、术前准备，术中管理、术后恢复等方面给予外科医师支持。开展3年，完成76例，移植成功率达到95%。另外，使用非生物人工肝治疗肝衰竭：人次位居重庆市前茅。2001年开始应用“人工肝”技术治疗肝衰竭，19年期间完成3000人次救治，将肝衰竭病死率下降到40%以下。
12. 急性妊娠脂肪肝和妊娠相关性肝病：妊娠女性发生的肝脏疾病对临床医生而言较为棘手。妊娠期肝脏异常需要在预期的妊娠生理变化背景下做出诊断。此外，诊断和治疗决策必须同时考虑到对母亲及胎儿的影响，且妊娠期肝脏疾病的类型和表现多种多样，使得诊治难度加大。我科在妊娠期急性脂肪肝（AFLP）、子痫前期和HELLP（溶血、肝酶升高、低血小板）综合征诊治方面优势突出，长期收治各种重症妊娠相关性肝病，获得患者及家属一致好评。
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