1957年，我国老一代著名传染病学专家钱悳教授、刘约翰教授、王其南教授、张定凤教授等人随华山医院分迁至重庆，创建重庆医科大学附属第一医院传染科。在60年建设和发展中获得多项殊荣：中国传染病学首批国家重点学科（全国仅2个）、首批传染病学硕士和博士点、 首批抗感染和寄生虫药物临床药理研究基地、西部地区第一个传染病与寄生虫病研究所。在重庆市历次重大传染病及重大公共卫生事件患者救治中一直担任指导单位。在复杂感染性疾病诊断、重症感染救治、抗感染药物临床应用以及寄生虫病诊治等方面局国内领先水平。建立了感染性疾病、感染危重症、肝病（肝衰竭）和寄生虫病四个亚专科。年均住院三千人，年均门诊六万人，年均急诊近一万人。2009和2011年入选中国医院最佳专科声誉排行榜。
1957-1965 开山拓业
1957年：正式成立重医一院传染科。
1960年：重医一院成立临床流行病学教研组，主要方向传染病，归传染病科管辖。
1961年：传染科建立微生物实验室
1964年：血防846研制成功。
1966-1976 风雨无阻
1970年：成立抗生素研究室：开展了硝硫氰胺、硝硫苯酯、阿苯达唑、左旋吡喹酮、氨基糖甙类、头孢菌素类、青霉素类、大环内酯类、氟喹诺酮类等90余种新药临床及药理研究，部分药物为国家“七五”、“八五”攻关新药。
1972年：赴渠县开展血吸虫防治。
1976-2000 厚积薄发
1979年：中国第一批硕士学位授予点。
1979年：刘约翰教授被选为传染病学教材第一版副主编，王其南教授为编委。
1981年：成为中国第一批博士授予点，陈雅棠教授为我科培养的西南地区首个传染病学博士。
1988年：建立西南传染病联盟，主办首届四省五方传染病学术会议。
1989年：被评为教育部重点学科，成为我国2个传染病学重点学科之一,也是西南地区唯一的一个西医重点学科。
1989年：四川省传染病学会成立，刘约翰教授任第一任主任委员。
1998年：新传染病大楼落成。
2001-2017 继往开来
2001年：被评为重庆市卫生局“感染病寄生虫病重点实验室”。
2001年：应用“人工肝”技术治疗肝衰竭，16年期间完成2千人次救治，将肝衰竭病死率下降到40%以下。
2003年：收治重庆市第一例SARS病例，在抗击“非典”的斗争中取得显著成绩，获市先进1人，校先进4人。
2005年：黄文祥教授作为专家组组长指导重庆市人-猪链球菌感染防治。
2006年：被评为国家肝病临床试验基地。
2007年：建立P2实验室，为医院开展病原微生物研究提供平台。
2008年：黄文祥主任被评为卫生部“全国先进工作者”。
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